原则上，符合强制退去事由的外国人会被要求强制离开日本，但是也有例外。法务大臣因为特殊的情况，即使符合强制退去事由的情况下，给与留在日本的权利的时候被称为在留特别许可。（参照入关法50条1项）

▲符合在留特别许可的情况

符合在留特别许可的情况可以分成以下几类。

1、日本人，永住者的家属：在非法来日，非法在日本滞留期间和日本人或者拥有永住身份的人（包括特别永住者）结婚的情况下，在和日本人，永住者之间有了孩子的情况下，外国人和日本人，永住者所生的孩子但是没有签证的情况下。

2、有孩子并长期滞在的家属：一家非法入国，并长期滞在日本。夫妇都是非法入国日本，在日本生了孩子。

3、难民或者是有难民性拥有者：虽然不能被视为难民，但是回国后会受到非人道对待的人。

4、被贩卖人口者：被以还钱的名义强制到饭店，风俗店工作的情况。

5、其它：很长时间在日本滞留。身患疾病，必须在日本接受治疗者。

▲在留特别许可的手续

1、符合上述理由希望获得在留资格者，不用等揭发到入管或者是警察，应自己到入管申告事实情况，表明自己在留的意愿和阐明理由。大多数这种情况下，不会被入管收容，可以在家中等待调查的结果。

2、审查结束后，入国警备官将收集的资料和申告人送往入国审查官。在此基点上决定是否可以假释。

3、入国审查官进行审查。对调查不足的事情进行聆讯。如果对调查结果有异议的情况下，可以在3日以内向特别审理官提出口头审理。

4、如果提出口头审理的请求，特别审理官会进行口头审理。判定有没有违反在留的认定。如果对判定不服，可以在3日以内向法务大臣提出异议。

5、即使法务大臣认为异议是没有理由，但是申请人曾经拥有永住许可，或者曾经拥有日本国民身份，或者被他人控制的情况下人身买卖在日本滞留，根据【法务大臣必须给与特别在留许可】，也有可能获得在留特别许可。

6、1-4的阶段里，各担当官只是对是否符合强制退去的情况真伪的调查，没有裁量权。到了第5阶段，法务大臣做最终裁量。

在现实当中，特别是和日本人结婚的情况，婚姻的实际情况，生计的安定性等没有问题的话，不用送到法务大臣，根据地方入国管理局的判断下就可以给特别在留许可。